Спустя десятилетие после знаковых событий первой части, семья Жизель и Роберта живёт на Манхэттене, но волшебство для Жизель утратило свою яркость. Скованная суетой мегаполиса, она тоскует по чудесам сказочного царства. Решив переменить жизнь, они переезжают в Монровиле, где их новый дом напоминает королевский замок. Через волшебный портал к ним прибывают старые друзья — король Эдвард и его супруга Нэнси.

Однажды, желая вернуть мир волшебству, Жизель пытается сотворить заклинание, но судьба распоряжается иначе: её действия ставят под угрозу жизни близких. Вдобавок, на горизонте возникает новая антагонистка — Мальвина Монро, владычица зачарованного пригорода. Теперь героине предстоит противостоять тьме, чтобы спасти тех, кого она любит, и восстановить хрупкий баланс между реальностью и фантазией.

После смерти Человека из Стали планета остаётся беззащитной перед новой опасностью. Древний завоеватель Степной Волк, служитель Дарксайда, прибывает на Землю, чтобы собрать три Материнских куба — артефакта, способных изменить реальность. Вдохновлённый подвигом Кента, Брюс Уэйн решает объединить сверхлюдей ради спасения мира.

Он находит Диану, затем подключает Барри, Артура и Виктора. Несмотря на разногласия, они становятся символом сплочённости. После череды поражений герои воскрешают Супермена, и его возвращение меняет ход сражения. Общими усилиями Лига побеждает, но впереди — новые угрозы.

Действие происходит в реальности, где Кал-Эл стал олицетворением противоречивой силы. Его поступки вызывают споры: кто-то считает его спасителем, другие — потенциальной опасностью. Брюс Уэйн, наблюдая разрушения в Метрополисе, убеждается, что Кларк представляет угрозу. Манипуляции Лекса Лютора усиливают раскол между двумя символами.

Тем временем надвигается новая опасность — монстр, созданный из ДНК генерала Зода. Объединив усилия, Бэтмен и Супермен находят взаимопонимание. Поступок Кларка, остановившего чудовище ценой жизни, вдохновляет людей. В финале появляется загадочный персонаж, предвещающий создание Лиги.

В центре повествования — трагические события, последовавшие за гибелью Супермена, чья смерть оставила глубокую брешь в мире. Пока человечество погружается в скорбь и хаос, древнее зло, известное как Степной Волк, возглавляющий армию Пардеморианцев, прибывает на Землю. Его цель — собрать три Материнских коробки, способные перекроить реальность по воле его хозяина, Дарксайда.

Брюс Уэйн, вдохновлённый самопожертвованием Кларка Кента, решает объединить героев для противостояния надвигающейся угрозы. Он находит Диану Принс, а затем привлекает к команде Барри Аллена, Артура Карри и Виктора Стоуна. Каждый из них — несовершенен, сломлен или отвергнут обществом, но вместе они становятся символом надежды. В финальной битве воскрешённый Супермен присоединяется к Лиге, и герои едва успевают остановить план Дарксайда поработить Землю. История завершается намёком на новые испытания, подчёркивая единство разношёрстной команды.

Планета Криптон оказывается на грани уничтожения после попытки переворота, организованного генералом Зодом. Джор-Эл, пытаясь сохранить будущее своей расы, прячет «Кодекс» — ключ к генетическому наследию Криптона — в капсуле с новорожденным сыном Кал-Элом, которая достигает Земли, где мальчика берет на воспитание человеческая семья, дав ему имя Кларк. С ранних лет он обнаруживает необычные способности, но его приемный отец настаивает на их скрытии, опасаясь непринятия со стороны людей.

Годы спустя Зод, изгнанный и одержимый местью, находит следы Кал-Эла и угрожает уничтожить мир. Перед суперменом встает выбор: присоединиться к Зоду для защиты человечества, которое еще не готово к встрече с героем. Теперь он должен решить, где его истинное место, и склониться перед судьбой, чтобы остановить надвигающуюся катастрофу.